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cleanNGS-高通量測序產(chǎn)物純化及片段篩選磁珠

來源: 重慶華雅思創(chuàng)生物醫(yī)藥科技有限公司    2020年11月23日 13:59  
CleanNGS-專為高通量測序產(chǎn)物純化及片段篩選而設(shè)計(jì)!

CleanNGS源于荷蘭CLEANNA公司,是一款專門為高通量測序而設(shè)計(jì)的磁珠試劑,同時(shí)滿足對目的片段的純化和目的片段篩選;既可以手工操作,也可以使用96孔或384孔板的形式完成。

產(chǎn)品優(yōu)勢:
1. 優(yōu)異的緩沖體系,100bp以上擴(kuò)增產(chǎn)物回收效率更高(100bp-10kb);
2. 有效去除dNTP、引物、引物二聚體、鹽離子和其他雜質(zhì);
3. 磁珠磁含量更高,磁吸附時(shí)間更短;
4. 既適用于DNA純化,也適用于RNA純化;
5. 可配套自動(dòng)化設(shè)備進(jìn)行高通量產(chǎn)物純化;
6. 手工操作和自動(dòng)化工作站操作均可適用;
7. 無RNA酶的生產(chǎn)過程確保能應(yīng)用于各種RNA的純化操作。
 
產(chǎn)品應(yīng)用:PCR產(chǎn)物純化、目的片段篩選

操作過程:
一、純化
1、添加CleanNGS和NGS文庫混合,或者將PCR產(chǎn)物和磁珠混合
2、吸附已經(jīng)和雜質(zhì)分離的磁珠,并且吸出含雜質(zhì)溶液
3、加入70%濃度的乙醇洗脫,然后吸附磁珠,重復(fù)該步驟
4、添加水,洗脫吸附在磁珠上的DNA,吸附磁珠,倒出純化后的PCR產(chǎn)物


二、片段篩選
1、添加NGS吸附大片段
2、用磁鐵吸附磁珠,使其從溶液中分離
3、將含有較小片段的上清液轉(zhuǎn)移到干凈的試管中
4、第二次加入磁珠,使其和需要的片段結(jié)合
5、用磁鐵吸住磁珠,倒棄有雜質(zhì)的上清
6、用80%乙醇洗脫磁珠
7、添加水進(jìn)行洗脫,使用磁力架,吸附磁珠,并倒出純化和篩選好的DNA片段


結(jié)果展示:
CleanNGS vs Competitor A(cleanNGS Single Cell Sequencing)

sample ID CleanNGS Competitor A
avg size (bp) conc (ng/ul) avg size (bp) conc (ng/ul)
1 696 26.7 691 25.9
2 580 27.1 587 25.3
3 569 27.6 567 25.4
4 607 28.3 603 27.1

                                                             




CleanNGS vs Competitor A(Control for qPCR inhibition)
 
sample ID CleanNGS Competitor A NTC
Ct (1x) 18.00 21.23 29.47
19.56 21.39 28.70
20.06 20.82 28.62

 

Human genomic DNA sheared to 150, 200, 400 and 1000 bp fragments using the Covaris S2.
Fragments have been pooled and 10 µL of 1.5 – 1.8 ng/µL sheared genomic DNA has been purified using 1.8x ratio (18 µL) of the appropriate beads. Nuclease free water was used as a NTC. After binding the beads were washed twice using 80% ethanol and dried at RT for 5 minutes.
An on-bead qPCR was performed after adding 20 µL of SYBR master mix to the bead pellet containing the purified genomic DNA.

更多規(guī)格:
包裝規(guī)格 測試數(shù)量 貨號
5mL 277 CNGS-0005
50mL 2777 CNGS-0050
500mL 27777 CNGS-0500

Number of reactions is based on a typical 10 µL PCR reaction volume.
Volume of CleanNGS to be used per reaction = 1.8x the sample volume.   

 現(xiàn)貨供應(yīng)。
代理商:重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司

                   

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