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HtPot40干式恒溫金屬浴在耐*銅綠假單胞菌CARB-3基因發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用

閱讀:1161      發(fā)布時(shí)間:2014-10-29
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銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa,Pa)是臨床常見的條件致病菌,由于其固有和獲得性耐藥,使臨床治療成為一大難題。CARB基因編碼產(chǎn)生*酶,為β-內(nèi)酰胺酶Bush分類中的2c,在我國CARB基因、流行基因亞型的研究未見報(bào)道。我們研究分析了2005年1~12月臨床分離的34株耐*銅綠假單胞菌(IMPRPa),發(fā)現(xiàn)了我院IMPRPa攜帶CARB-3基因,現(xiàn)總結(jié)報(bào)告如下。

 
 
  1  材料與方法
  1.1  菌株來源與質(zhì)控菌株  34株耐*銅綠假單胞菌來自于2005年1~12月我院住院病人的臨床分離標(biāo)本(包括:痰液、尿液、傷口分泌物、膿液、血液等),質(zhì)控菌株包括:銅綠假單胞菌ATCC27853,大腸埃希菌ATCC25922。
 
  1.2  菌株鑒定及*耐藥菌株篩選  試驗(yàn)菌株經(jīng)BD Phoenix100全自動微生物分析儀鑒定到種,采用該儀器配套藥敏試驗(yàn)復(fù)合板篩選*耐藥的Pa。
 
  1.3  主要儀器設(shè)備與試劑  Eppendorf centrifuge 5417R 低溫離心機(jī),HtPot40干式恒溫金屬?。ê戏拾旧珺io-RAD電泳儀,Bio-RAD 凝膠成像系統(tǒng), 瓊脂糖(OXOID),100bp DNA Ladder Marker(大連寶森),6×Loading buffer(北京天為時(shí)代)。
 
  1.4  模板DNA提取  采用蛋白酶K消化法。
 
  1.5  基因擴(kuò)增  引物序列為:P1:5′-AAA GCA GAT CTT GTG ACC TATTC -3′,P2: 5′-TCA GCG CGA CTG TGA TGT ATA AAC -3′,擴(kuò)增產(chǎn)物為588bp。熱循環(huán)參數(shù)為:93℃預(yù)變性3min,93℃ 60s,55℃ 60s,72℃ 60s,zui后一個(gè)72℃ 延伸5min,共循環(huán)35周期。純水為陰性對照。耐藥基因檢測試劑盒由無錫市克隆遺傳技術(shù)研究所提供。
 
  1.6  結(jié)果判斷  取10μl擴(kuò)增產(chǎn)物與2μl 6×上樣緩沖液混勻,點(diǎn)樣于1.5%瓊脂糖凝膠,在100V電壓電泳30min,出現(xiàn)588bp的條帶即為CARB基因陽性。用凝膠成像系統(tǒng)觀察并照相。
 
  1.7  序列分析  PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后送上海生工生物工程公司進(jìn)行DNA序列分析,測得序列在www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST  中的BLASTn程序進(jìn)行同源性和基因亞型分析。
 
  2  結(jié)果
 
  2.1  CARB基因PCR檢測結(jié)果  34株耐*銅綠假單胞菌共檢出11株CARB基因陽性株,檢出率為32.4%,PCR擴(kuò)增結(jié)果見圖1。
 
  2.2  序列分析結(jié)果  任意抽取5株CARB基因陽性的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行單向測序,測得序列與GenBank中注冊號為DQ309773的CARB-3基因*同源(Identities=100%)。因此我院流行的CARB基因亞型為CARB-3型。
 
  圖1  部分Pa菌株CARB基因PCR產(chǎn)物電泳圖?。裕?/div>
 
  3  討論
 
  CARB基因zui早于1981年在Pa中發(fā)現(xiàn)[1],近年又從不動桿菌、弧菌屬、奇異變形桿菌中檢出,已發(fā)現(xiàn)CARB1-9型9個(gè)亞型[2~4]。我院IMPRPa的CARB基因攜帶率為32.4%,提示醫(yī)務(wù)工作者應(yīng)重視和加強(qiáng)Pa的防治和耐藥監(jiān)測。對CARB基因陽性菌株進(jìn)行DNA序列分析,經(jīng)同源性比較,結(jié)果顯示:我院流行的CARB基因亞型為CARB-3型。IMPRPa中CARB基因檢出、CARB-3基因亞型發(fā)現(xiàn)為國內(nèi)報(bào)道。
 
  銅綠假單胞菌是臨床常見的條件致病菌,正常情況下不感染人體任何組織,但當(dāng)人體免疫力下降或嚴(yán)重創(chuàng)傷或醫(yī)療操作后,Pa幾乎可以感染人體的任何組織,臨床可表現(xiàn)為局部化膿性炎癥和全身性感染,常常危及患者生命。碳青霉烯類抗生素(如*)因其*的抗菌優(yōu)勢,被臨床廣泛用于Pa引起的重癥感染,導(dǎo)致臨床分離株對*耐藥性增加。
 
  Pa對*耐藥的機(jī)制主要有膜孔蛋白缺失、外排泵和產(chǎn)酶等三種機(jī)制[5]。我們對IMPRPa的耐藥機(jī)制的相關(guān)研究正在進(jìn)行中。
  作者:顏英俊 糜祖煌 劉華 楊洋 張凱 楊明清 黃文方    中華醫(yī)學(xué)研究雜志
 
  【參考文獻(xiàn)】
  1  Paul G,Joly G ML,Bergogne BE,et al.Novel carbenicillin-lydrolyzing β-lactamases(CARB-5)from Acinetobacter calcoaceticus var.anitratus.FEMS Microbiol Lett,1989,50(1-2):45.
  2  Alejandro P,Roberto G M,Hector AS,et al.CARB-9 a carbenicillinase encoded in the VCR region of Vibrio cholerae Non-O1,Non-O139belongs to a family of cassette-encoded β-lactamases.Antimicrob Agents Chemother,2004,48(10):4042.
  3  Nucleotide sequence of the blaRTG-29CARB-5) gene and phylogeny of a new group of carbenicillinases.Antimicrob Agents Chemother,2000,44(4):1070.
  4  Bert F,Branger C,Lambert-zechovsky N.Comparative activity of beta-lactam agents (carbapenem excepted)against Pseudomonas aeruginosastrains with CARB or OXA beta-lactamASES.Chemotherapy,2004,50(1):31.
  5  Okamoto K,Gotoh N,Nishino T.Pseudomonas aeruginosa reveals high intrinsic resistance to penem antibiotics:penem resistance mechanisms and their interplay.Antimicrob Agents Chemother,2001,45(7):1964.
  作者單位:1 610072 四川成都,四川省醫(yī)學(xué)*、四川省人民醫(yī)院檢驗(yàn)科2 214026 江蘇無錫,無錫市克隆遺傳技術(shù)研究所

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